Международная группа учёных создала программный инструмент KEGGaNOG, упрощающий анализ метаболических свойств бактерий

Специалисты из Донского государственного технического университета, Первого Московского государственного медицинского университета имени И.М. Сеченова и Вагенингенского университета (Нидерланды) разработали программу для быстрого анализа полезных свойств бактерий.

Новый инструмент KEGGaNOG позволяет автоматически анализировать особенности обмена веществ у микроорганизмов. Он помогает быстро определить, какие полезные вещества, включая витамины, способны синтезировать бактерии. Это значительно облегчает оценку потенциала разных видов для биотехнологий. Программа может применяться при поиске штаммов для создания пробиотиков и других биодобавок. Исследование поддержано грантом Российского научного фонда. Результаты исследования опубликованы в журнале Molecular Nutrition & Food Research.

Бактерии активно используются в биотехнологиях для производства витаминов, антибиотиков, ценных ферментов и других веществ. Некоторые микроорганизмы входят в состав пробиотиков, улучшающих пищеварение и укрепляющих иммунитет. Для понимания пользы определённого вида бактерий нужно расшифровать его геном, поскольку способность синтезировать полезные соединения зависит от наличия соответствующих генов.

Синтез большинства полезных веществ, таких как витамины, включает несколько стадий. Учёным приходится искать целый ряд разных генов, определять их функции и составлять схемы метаболических путей. Этот процесс очень долгий и трудоёмкий, особенно при анализе сотен видов бактерий.

Международная группа учёных разработала инструмент KEGGaNOG. Он помогает быстро оценивать метаболические возможности бактерий. По словам Игоря Попова, научного сотрудника Донского государственного технического университета, идея создания инструмента возникла, когда команда