ИИ AlphaFold 3 нашел мишень для вакцины от оспы обезьян, которую годами не замечали ученые

Международная команда ученых из Италии и США с помощью модели AlphaFold 3 обнаружила белок OPG153 — перспективную мишень для вакцины и антительной терапии против вируса оспы обезьян (mpox). Этот поверхностный белок вируса раньше никто не рассматривал как цель для нейтрализующих антител. Результаты опубликованы в журнале Science Translational Medicine.

Нынешние вакцины от mpox — адаптированные противооспенные препараты на основе ослабленного вируса. Они эффективны, но сложны и дороги в производстве: приходится работать с целым вирусом, у которого десятки поверхностных белков. Во время вспышки 2022 года, когда mpox заразились более 150 000 человек по всему миру, это стало узким местом в борьбе с эпидемией.

Исследователи из Fondazione Toscana Life Sciences выделили из крови переболевших и вакцинированных пациентов 12 антител, эффективно нейтрализующих вирус. Проблема была в том, что ученые не знали, какие именно из примерно 35 поверхностных белков вируса эти антитела атакуют. Команда Джейсона Маклеллана из Техасского университета в Остине использовала AlphaFold 3 для предсказания — модель с высокой достоверностью указала на белок OPG153. Лабораторные тесты подтвердили результат. "Без ИИ на поиск этой мишени ушли бы годы, — говорит Маклеллан. — Никто раньше не рассматривал этот белок для разработки вакцин или антител".

Когда мышам ввели белок OPG153, у них выработались антитела, нейтрализующие вирус mpox. Один белок вместо целого вируса — это потенциально проще и дешевле в производстве. Кроме того, OPG153 консервативен у разных поксвирусов: антитела к нему работают против mpox клад Ib и IIb, вируса коровьей оспы и перекрестно реагируют с вирусом натуральной оспы. Последнее важно для биобезопасности — натуральная оспа