BioNTech и InstaDeep разработали систему раннего обнаружения опасных штаммов коронавируса

Фармацевтическая компания BioNTech и стартап InstaDeep разработали ИИ-систему раннего предупреждения (EWS), которая анализирует данные секвенирования генома SARS-CoV-2 и прогнозирует варианты с высоким риском.

We, together with @instadeepai, have developed an Early Warning System as a new computational method detecting high risk #SARS-CoV-2 variants. In trial period, the system identified >90% of @WHO designated variants 2mths before their official designation. https://t.co/XJgH4LjHLE pic.twitter.com/vAQN2y9lVQ— BioNTech SE (@BioNTech_Group) January 11, 2022

Новый метод сочетает структурное моделирование вирусного шиповидного белка и алгоритмы искусственного интеллекта. Это позволяет системе быстро помечать потенциальные опасные варианты коронавируса на основе показателей, оценивающих их приспособленность и умение ускользать от иммунного ответа.

Во время испытаний EWS идентифицировала более 90% вариантов за два месяца до того, как их определила ВОЗ. Обозначенные организацией штаммы «альфа», «бета», «гамма», «тета» и «эта» система обнаружила на той же неделе, когда ученые загрузили информацию о них в базу данных. Версию «омикрон» EWS отметила как высокорисковую в тот же день, когда его последовательность стала доступна.

Результаты исследования подчеркивают, что EWS может оценивать новые варианты за считанные минуты и отслеживать их родословные почти в режиме реального времени. Она также способна масштабироваться по мере появления новых данных о мутациях коронавируса.

Соучредитель и генеральный директор InstaDeep Карим Бегир рассказал, что каждую неделю обнаруживается более 10 000 новых последовательностей вариантов, и эксперты-люди не могут справиться со сложными данными в таком масштабе.

«Впервые варианты с высоким