Находит кандидаты в лекарства за десятки секунд: Китай запустил ИИ GalaxyVS на суперкомпьютерах Tianhe

В Китае запустили государственную платформу GalaxyVS для виртуального скрининга лекарств. Она работает на новом поколении суперкомпьютеров Tianhe, сокращает первичный отбор кандидатов в лекарства с месяцев или лет до десятков секунд и в миллион раз превосходит мировой рекорд по молекулярному докингу — компьютерному моделированию того, как молекула стыкуется с белком-мишенью. О запуске сообщила официальная китайская газета по науке и технологиям "Кэцзи жибао" со ссылкой на разработчиков.

Платформу совместно сделали Национальный суперкомпьютерный центр в Тяньцзине и научное подразделение университета Цинхуа по прикладному ИИ. Команда Цинхуа принесла в проект DrugCLIP — свой метод сверхбыстрого виртуального скрининга, опубликованный в Science в январе. Центр в Тяньцзине предоставил вычислительную инфраструктуру: суперкомпьютеры серии Tianhe (Тяньхэ), которые в 2010 году ненадолго становились самыми быстрыми в мире.

Логика DrugCLIP простая: не моделировать физическое взаимодействие молекул, как делает классический докинг, а превратить поиск лекарства в задачу типа поисковой выдачи. Две нейросети превращают активный участок белка-мишени (место, куда должна пристыковаться молекула) и саму молекулу-кандидата в вектора в общем пространстве — если вектора близки, молекула подходит. Вместо симуляции миллиардов вариантов система просто измеряет расстояния. В январской работе команда из Цинхуа за сутки на восьми GPU обработала 10 триллионов пар "белок — молекула" — классическому докингу на это потребовались бы столетия.

Теперь метод перенесли на государственную суперкомпьютерную инфраструктуру и упаковали в платформу. По словам разработчиков, GalaxyVS должна дать новый способ искать кандидатов в лекарства от опухолей,